This article puts forward a alignment-free sequence comparison method based on whole genomes and draws phylogeny trees for 9 Hepadnaviridae viruses and 14 Caulimoviridae viruses with this method.

• 本文提出了一种基于高维空间几何分析的序列对比方法；并应用该方法对9个嗜肝病毒科病毒和14个花椰菜花叶病毒科病毒做出了进化树；结果完全符合国际病毒学命名委员会公布的病毒分类标准.